Озера Белое, Черное и Святое известны в русской истории с XIV века.

Они связаны с великими московскими князьями, с героями Куликовской битвы, с московским Богородице-Рождественским монастырем, дворянами Телепневыми. Царевичем Петром Алексеевичем и знаменитым московским благотворителем купцом первой гильдии Дмитрием Александровичем Лухмановым. Легенды Святого озера содержат предсказание о зарождении Москвы. Святое озеро стало местом паломничества, оно было обязательным местом посещения православных москвичей.

Три подмосковных озера привлекли внимание художников, археологов и ученых-естествоиспытателей. В начале ХХ века на озерах была создана лимнологическая станция Императорского Московского университета. Изучение продолжилось в советское время, в 1923 году по решению Совнаркома создается Косинский заповедник. Остались научные труды Косинской Биологической станции. Косинские озера известны ученым-лимнологам не только России, но и всего мира.

В 1985 году Косино вошло в состав Москвы. Антропогенная нагрузка на единственные в столице природные озера растет от года к году. Озеро Святое резко обмелело в 2011-2012г.; строительство Некрасовской ветки метро не дало восстановиться озеру. В 2019 году зафиксировано понижение уровня озера на 1,75 м по Балтийской системе. Строительство начатое в марте 2023 года, на площади 9,9 га рядом со Святым озером приведет к непоправимым последствиям. Площадь стройки, которая находится на территории его водосбора, превышает зеркало самого озера.

Общественная организация «ЭКОПОЛИС-КОСИНО» существует с 1985 года. Задача этой организации – изучение, экологическое просвещение и защита Косинских озер. Активисты рассказывают об истории и проблемах Природно-исторического парка «Косинский».